第五管区海上保安本部は、兵庫県（南部）・大阪府・和歌山県・徳島県・高知県の前面海域及び和歌山県・高知県などの南方沖合約1,250kmまでの広範囲を担任水域とし、兵庫県神戸市にある本部のほか、20カ所ある海上保安部署・事務所と49隻の船艇、5機の航空機、そして約1,200人の職員により、海上保安業務にあたっています。